百团大战按作战计划预定步骤及发展的情况，可分为三个不同的作战阶段。第一阶段，自8月20日20时大战爆发时起至9月10日。20天的时间完成第一个月的预定作战任务。这阶段的作战中心任务为交通总破击战，破坏与截断华北敌军全部交通，粉碎敌寇当时进攻昆明、重庆及西安的企图袁 而作战重点则以毁灭正太路为主要目的。第二阶段自9月20日开始至10月下旬。这阶段作战的中心任务为继续扩大第一阶段的站果，继续破击交通线袁 而重点则在歼灭交通线两侧和深入我各根据地中的敌寇据点，并分由晋东南的辽榆战役，晋察冀边区的涞灵战役，晋西北的同蒲路宁武南北段破击战役，冀中的河任战役，冀南区之破击德石路邯济路战役等所组成。第三阶段自10月6日，至12月5日。

我军第一、二阶段的胜利，给敌寇当时进攻重庆昆明、西安的企图以严重打击，使敌对“堡垒主义”“囚笼政策”丧失了信心。在国际形势巨变之下，日军准备南进而不得不暂时放弃对昆明、重庆、西安的进攻，进而转向华北各根据地进行频繁的大“扫荡”，以其“扫荡”华北八路军的军事行动，配合诱降、劝降之巨大阴谋，引诱亲日派和反共派发动内战，实现投降，以达成其解决“中国事件”，遂得以南进的目的。因此，反“扫荡”便成为我方第三阶段作战的中心任务。但因各地区具体情况不同，反“扫荡”的发起及终结时间亦各不一致，包括在晋东南太北区自10月6日至11月12日的三次反“扫荡”，平西区自10月10日至10月28日的反“扫荡”，晋西北自10月27日至11月初的反“扫荡”，雁门区11月7日至同月中旬的反“扫荡”，晋察冀边区自11月下旬至12月5日的连续反“扫荡”，太岳区自11月18日至同月底的反“扫荡”，12月1日太南区开始的反“扫荡”战，以及向德石路、沧石路、邯济路的继续破击，与冀中冀南大青山的反复局部反“扫荡”等。

百团大战第二阶段发起后，苏鲁皖豫境内的八路军，为配合百团大战，亦各自向当前之敌作积极活动，计有 115师向津浦路天津德州段之破击战，济南至徐州段之破击战，鲁南鲁西北消灭敌据点之作战，山东纵队在胶济路之破击战，胶东胶北之消灭敌据点之作战，二纵队在冀豫边区袭敌据点及反“扫荡”作战，第三、第四、第五各纵队在徐州以南津浦路之破击战。在陇海东段之破击战，及在淮河运河沿岸之拔除敌据点之作战。