1916高君宇考入北京大学,不久,著名教育学家蔡元培担任北大校长,实行“兼容并包”提倡学术自由。在此治校方针的影响下,北大很快成为中国新思想波澜翻卷的中心,在俄国“十月革命”和李大钊的影响下,高君宇很快成为思想激进青年的学生领袖。
1919年五四运动爆发,高君宇是这一运动的组织者和领导者之一。北大及北京各校同学约3000余人汇集于天安门广场,然后游行队伍到赵家楼胡同卖国贼曹汝霖住宅示威。在发现曹宅铁门紧闭时,高君宇等热血青年带领爱国学生冲进曹家大院,火烧赵家楼,殴击章宗祥,谱写了中国近代史上光辉而壮丽的一页。